帳票PDFとCSVも一緒に発行する時、取引先に送られるCSVの並び順を変更できますか？

変更できます。

【手順】

1. 基本設定＞表示項目設定＞マイページ欄の「 帳票データ(CSV)」の左にある鉛筆マークをクリックします。
2. すべての帳票で同じ設定にするか、帳票ごとに個別に設定するか選択し
   「次へ」をクリックします。
3. 表示させたい項目を左側のボックスへ、ドラッグ＆ドロップで移動させます。
4. 完了後、「設定する」をクリックすると設定した内容で顧客にCSVが
   発行されます。

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